初创于宋绍兴十年（1140年），清嘉庆七年（1579年），光绪二年（1876年）重修。占地面积5526平方米。采用中轴线布局，高台基殿堂式结构。主要建筑物有照壁、棂星门、泮桥、泮池、大成门、东西庑、大成殿、崇圣祠等。主体建筑均为高台基、大圆柱、红瓦绿檐，造型富丽堂皇，庄严肃穆，是广东省同类建筑物之规模较大、保存完好的一座，具有较高的科研价值和艺术水平。大成殿悬挂历代御颁匾额如：“万世师表”、“生民未有”、“圣集大成”、“与天地共参”等。正殿塑大成至圣先师孔子像，左设复圣颜子、宗圣曾子，右设述圣子思子、亚圣孟子，圣殿前左右列十二尊先哲。
孔庙又是革命活动旧址，1925年周恩来在第二、二次东征时，曾在此中办公。1927年秋天，南昌起义部队到达揭阳时，周恩来、贺龙、叶挺等领导人也曾在学宫明伦堂召开军事会议。1957年，学宫被列为广东省重点文物保护单位，后又被省命名为“周恩来同志革命活动旧址”。
揭阳诗人东篱香有词一阕《调寄〈江城子〉》专赞孔庙。词云：
崇阶玉殿焕辉煌，转庑廊，仰祠堂，瑞霭氤瘟，飞凤逐翔凰；锦鲤文鳌争活跃，云化彩，日升光。
海滨邹鲁称名邦，水共山，气泱泱，人杰地灵，华国有文章。几度沧桑都过尽，添绿树，护红墙。
