喀斯特水文地质景观主要由地下河出口、地下河天窗、瀑布、喀斯特潭、喀斯特上升泉、下降泉、多潮泉、滞流泉、喀斯特地下溶洞等组合而成。这些水文地质现象与一般的喀斯特地区现象没有什么本质差别，但是河水、泉水、溪水的出口和流过的地方，大多被森林树木所掩盖，深山密林之中，清溪长流，深潭宁静，瀑布轰鸣。于是，迷人的动态的奇特的喀斯特水景出现在大家面前。

    走在保护区内，一路上会看到不断有喀斯特潭和地下河天窗出现，面积一般有数十平方米，潭水湛蓝，也能见到地下河特有的鱼儿漫游，瀑布跌水接连不断。还有，来无影去无踪的地下河水，地表流水迂回曲折，密林中清流若隐若现，常常是只闻其声不见其形。

    茂兰喀斯特洞穴发育极为丰富，已经探明有旅游和探险价值的就有20多个。这些洞穴基本分为两层，上层洞多在山峰半腰中，下层洞在地表以下，多为地下河的通道。这些洞穴气势壮观，神秘莫测，是进行探险、旅游、考察地下世界的好地方。